Ngày 20/06/2017, Ủy ban nhân dân Thành phố ban hành Quyết định số 3197/QĐ-UBND cho phép thành lập Trường Trung học phổ thông Năng khiếu Thể dục - Thể thao huyện Bình Chánh trực thuộc Sở Giáo dục và Đào tạo, tại ấp 1, xã Lê Minh Xuân, huyện Bình Chánh, Thành phố Hồ Chí Minh. Trường Trung học phổ thông Năng khiếu Thể dục - Thể thao huyện Bình Chánh là đơn vị sự nghiệp giáo dục và đào tạo công lập, có tư cách pháp nhân, có con dấu riêng, được cấp kinh phí hoạt động và mở tài khoản tại Kho bạc Nhà nước theo quy định hiện hành. Trường thực hiện chức năng nhiệm vụ theo quy định tại Thông tư số 12/2011/TT-BGDĐT ngày 28 tháng 3 năm 2011 của Bộ Giáo dục và Đào tạo ban hành Điều lệ Trường trung học cơ sở, trường trung học phổ thông và trường phổ thông có nhiều cấp học.

Trần Phát